原核細胞（prokaryotic cell）是組成原核生物的細胞。這類細胞主要特征是沒有以核膜為界的細胞核， 也沒有核仁， 只有擬核。進化地位較低。細胞器只有核糖體，有細胞膜，成分與真核細胞不同。細胞較小，沒有成型的細胞核，沒有染色體，DNA不與蛋白質結合。
細胞種類
原核生物（prokaryote）是以原核細胞構成的，均為單細胞生物，通常稱為細菌（bacterium）。
根據外表特征，可把原核生物粗分為“三菌三體"6種類型，即細菌（狹義的）、放線菌、藍細菌、支原體、立克次氏體和衣原體。
細菌
是在自然界分布最.廣、個體數量最多的有機體，是大自然物質循環的主要參與者。細菌主要由細胞壁、細胞膜、細胞質、核質體等部分組成，有的細菌還有莢膜、鞭毛、菌毛等特殊結構。絕大多數細菌的直徑大小在0.5-5微米之間。可根據形狀分成三類：球菌、桿菌和螺旋菌。
放線菌微米
放線菌是具有菌絲、以孢子進行繁殖、革蘭氏染色陽性的一類原核微生物。因其具有分枝狀菌絲、菌落形態與霉菌相似，過去曾認為放線菌是"介于細菌與真菌之間的微生物"。然而，用近代生物學技術所進行的研究結果表明，放線菌實際上是屬于細菌范疇內的原核微生物，只不過其細胞形態為分枝狀菌絲。從系統發育上看，放線菌（除高溫放線菌外）與全部G+細菌一起同屬于這一大分支中的高G+C/mol%群。
藍藻
藍藻又稱藍細菌（cyanobacterium），能進行與高等植物類似的光合作用（以水為電子供體，放出氧氣），與光合細菌的光合作用的機制不一樣，因此被認為是最.簡單的植物。藍藻沒有葉綠體，但含有藻藍素（呈藍色，但含量少）和葉綠素（呈綠色并且含量多），是能夠進行光合作用的自養生物。細菌中絕大多數種類是營腐生或者寄生生活的一種生物。藍藻和細菌中，都沒有成型的細胞核。藍藻細胞遺傳信息載體與其它原核細胞一樣，是一個環狀DNA分子，但遺傳信息量很大，可與高等植物相比。因為藍藻細胞的體積比其它原核細胞大得多，直徑一般在10微米，甚至可達70微米（顫藻），所以肉眼不能看清藍藻細胞。藍藻屬單細胞生物，有些藍藻經常以絲狀的細胞群體存在，如：屬藍藻門念珠藻類的發菜（nostoc commune var.flagtlliforme）就是藍藻的絲狀體；發菜生長在西北草地和荒漠，因為和“發財"諧音，所以被人爭相食用，現已被我國列為保護生物；做綠肥的紅萍實際上是一種固氮藍藻與水生蕨類滿江紅的共生體。藍球藻，念珠藻，顫藻，發菜（細胞群體呈黑藍色）均屬于藍藻，所以藍藻并不都是呈現綠色的。
支原體
支原體（mycoplasma）的大小通常為0.2-0.3微米，是現認為最小的細胞，可通過濾菌器。無細胞壁，不能維持固定的形態而呈現多形性。細胞膜中膽固醇含量較多，約占36%，這對保持細胞膜的完整性是必需的，凡能作用于膽固醇的物質（如二性霉.素B、皂素等）均可引起支原體膜的破壞而使支原體死亡。
支原體基因組為一環狀雙鏈DNA，分子量小（僅有大腸桿菌的五分之一），合成與代謝很有限。肺炎支原體的一端有一種特殊的末端結構（terminal structure），能使支原體粘附于呼吸道粘膜上皮細胞表面，與致病性有關。
衣原體和立克次氏體
衣原體（Chlamydia）很小，直徑200-500納米，能通過細菌濾膜。立克次氏體（Rickettsia）略大，大多不能通過濾菌膜。它們都有DNA和RNA，有革蘭氏陰性細菌特征的含肽聚糖的細胞壁，但酶系統不*，必須在寄主細胞內生活，有攝能寄生物（energe parasite）之稱。
砂眼是衣原體引起的，由于能形成包含體，起初被認為是大型病毒，1956年，中國著名微生物學家湯飛凡及其助手張曉樓等人首.次分離到沙眼的病原體
衣原體生活史特殊，具有感染力的個體稱為原體（elementory body），體積小，有堅韌的細胞壁。在宿主細胞內，原體逐漸伸長，形成無感染力的個體，稱作始體（initial body），是一種薄壁的球狀細胞，體積較大，通過二等分裂的方式在宿主細胞內形成一個微菌落，隨后大量的子細胞有分化為具有感染能力的原體。立克次氏體也是專性細胞內寄生的，主要寄生于節肢動物，有的會通過蚤、虱、蜱、螨傳入人體、如斑疹傷寒、戰壕熱。
美國醫生H.T.Richetts 1909年首.次發現它是落基山斑疹傷寒的病原體，并于1910年犧牲于此病，故后人稱這類病原體為立克次氏體。與衣原體的不同處在于其細胞較大，無濾過性，合成能力較強，且不形成包涵體。
繁殖
細菌以一分為二的方式繁殖，某些細菌處于不利的環境，或耗盡營養時，形成內生孢子，又稱芽孢，是對不良環境有強抵抗力的休眠體，由于芽胞在細菌細胞內形成，故常稱為內生孢子。
芽孢的生命力非常頑強，有些湖底沉積土中的芽孢桿菌經500-1000年后仍有活力，肉毒梭菌的芽孢在pH7.0時能耐受100℃煮沸5-9.5小時。芽孢由內及外有以下幾部分組成：
1．芽孢原生質（spore protoplast）：核心（core）含濃縮的原生質。
2．內膜（inner membrane）：由原來繁殖型細菌的細胞膜形成，包圍芽孢原生質。
3．芽孢壁（spore wall）：由繁殖型細菌的肽聚糖組成，包圍內膜。發芽后成為細菌的細胞壁。
4．皮質（cortex）：是芽孢包膜中最厚的一層，由肽聚糖組成，但結構不同于細胞壁的肽聚糖，交聯少，多糖支架中為胞壁酐而不是胞壁酸，四肽側鏈由L-Ala組成。
5．外膜（outer membrane）：也是由細菌細胞膜形成的。
6．外殼qiao（coat）：芽孢外殼，質地堅韌致密，由類角蛋白（keratinlike protein）組成，含有大量二硫健，具有疏水性特征。
7．外壁（exosporium）：芽孢外衣，是芽孢的最外層，由脂蛋白及碳水化合物（糖類）組成，結構疏松。
